税务部门会核对申报的扣除项目和相应的材料。个人可以通过银行查询余额或者收到退税通知单来核实退税金额。需要注意的是，个人所得税专项附加扣除的退税流程可能会根据不同地区的税务政策有所不同，因此具体的退税流程还需根据相关地方性法规与税务部门规定执行。
个人所得税专项附加扣除的退税流程如下：
1. 办理报税：个人应按照规定办理年度个人所得税纳税申报，包括申报居民个人所得税的预缴税款和年度个人所得税汇算清缴。
2. 核对扣除项目：个人在申报过程中需要提供相关材料证明专项附加扣除的项目，如住房租金、房贷利息等。税务部门会核对申报的扣除项目和相应的材料。
3. 审核退税资格：税务部门会审核个人的扣除项目是否符合法定条件，以确定个人是否有资格退税。
4. 退税办理：当个人具备退税资格时，税务部门会将退税款项退还到个人的银行账户中。个人可以通过银行查询余额或者收到退税通知单来核实退税金额。
需要注意的是，个人所得税专项附加扣除的退税流程可能会根据不同地区的税务政策有所不同，因此具体的退税流程还需根据相关地方性法规与税务部门规定执行。